De Berchtesgadener Alpen liggen in Zuid-Duitsland (Beieren), maar ook in Oostenrijk (Salzburg). De bergen houden zich niet aan de landsgrenzen, dus de grenzen liggen meestal op een berg. De Berchtesgadener Alpen grenzen onder andere aan de volgende berggebieden: Salzkammergut, Kitzbüheler Alpen, Loferer Steingebirge en de Beierse Alpen.

De Hochkönig is een 2941 meter hoge berg in het Oostenrijkse Salzburger Land en is daarmee de hoogste bergtop van de Berchtesgadener Alpen. Andere hoge bergen zijn de Watzmann (2713 m), Torsäule (2587 m), Selbhorn (2655 m) en de Breithorn (2504 m).