De Berchtesgadener Alpen liggen in Zuid-Duitsland (Beieren), maar ook in Oostenrijk (Salzburg). De bergen houden zich niet aan de landsgrenzen, dus de grenzen liggen meestal op een berg. De Berchtesgadener Alpen grenzen onder andere aan de volgende berggebieden: Salzkammergut, Kitzbüheler Alpen, Loferer Steingebirge en de Beierse Alpen.

De Hochkönig is een 2941 meter hoge berg in het Oostenrijkse Salzburger Land en is daarmee de hoogste bergtop van de Berchtesgadener Alpen. Andere hoge bergen zijn de Watzmann (2713 m), Torsäule (2587 m), Selbhorn (2655 m) en de Breithorn (2504 m).

In 1978 is het Nationaal Park Berchtesgaden opgericht (210 km2). In het park ligt onder andere de  Königsee. Dit meer ligt op 603 meter en is ongeveer 6 kilometer lang en 1 kilometer breed. Het ligt tussen de bergen en het lijkt daarom een beetje op de Noorse Fjorden.